Python Module Index

s


	s
	`singlecellmultiomics`
	`singlecellmultiomics.alleleTools`
	`singlecellmultiomics.alleleTools.alleleTools`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.alignment_view`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamDuprate`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamExtractRandomPrimerStats`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamFeatureDensityVisualisation`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamFilter`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamFunctions`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamMappingRate`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamPlateVisualisation`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamPlotRTstats`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamTabulator`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamToCountTable`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.bamToMethylationAndCopyNumber`
	`singlecellmultiomics.bamProcessing.variantStats`
	`singlecellmultiomics.barcodeFileParser`
	`singlecellmultiomics.barcodeFileParser.barcodeFileParser`
	`singlecellmultiomics.countTableProcessing`
	`singlecellmultiomics.countTableProcessing.correct_count_table_bias`
	`singlecellmultiomics.countTableProcessing.downsampleDataFrame`
	`singlecellmultiomics.fastaProcessing`
	`singlecellmultiomics.fastaProcessing.fastaMaskVariants`
	`singlecellmultiomics.fastqProcessing`
	`singlecellmultiomics.fastqProcessing.fastqHandle`
	`singlecellmultiomics.fastqProcessing.fastqIterator`
	`singlecellmultiomics.features`
	`singlecellmultiomics.features.exonGTFtoIntronGTF`
	`singlecellmultiomics.features.features`
	`singlecellmultiomics.fragment`
	`singlecellmultiomics.fragment.chic`
	`singlecellmultiomics.fragment.fragment`
	`singlecellmultiomics.fragment.nlaIII`
	`singlecellmultiomics.libraryDetection`
	`singlecellmultiomics.libraryDetection.archivestats`
	`singlecellmultiomics.libraryDetection.sequencingLibraryListing`
	`singlecellmultiomics.libraryProcessing`
	`singlecellmultiomics.libraryProcessing.libraryStatistics`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.baseDemultiplexMethods`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexedFastqConversion`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexingStrategyLoader`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexModules`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexModules.BULK_ILLUMINA`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexModules.CELSeq1`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexModules.CELSeq2`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexModules.Hexamer`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexModules.MSPJI`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexModules.NLAIII`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexModules.restrictionbisulfite`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexModules.scartrace`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demultiplexModules.scCHIC`
	`singlecellmultiomics.modularDemultiplexer.demux`
	`singlecellmultiomics.molecule`
	`singlecellmultiomics.molecule.chic`
	`singlecellmultiomics.molecule.consensus`
	`singlecellmultiomics.molecule.featureannotatedmolecule`
	`singlecellmultiomics.molecule.filter`
	`singlecellmultiomics.molecule.fourthiouridine`
	`singlecellmultiomics.molecule.iterator`
	`singlecellmultiomics.molecule.molecule`
	`singlecellmultiomics.molecule.nlaIII`
	`singlecellmultiomics.molecule.rna`
	`singlecellmultiomics.molecule.taps`
	`singlecellmultiomics.pyutils`
	`singlecellmultiomics.pyutils.handlelimiter`
	`singlecellmultiomics.pyutils.pyutils`
	`singlecellmultiomics.statistic`
	`singlecellmultiomics.statistic.allele`
	`singlecellmultiomics.statistic.cellreadcount`
	`singlecellmultiomics.statistic.conversions`
	`singlecellmultiomics.statistic.datatype`
	`singlecellmultiomics.statistic.fragmentsize`
	`singlecellmultiomics.statistic.mappingquality`
	`singlecellmultiomics.statistic.methylation`
	`singlecellmultiomics.statistic.oversequencing`
	`singlecellmultiomics.statistic.plate`
	`singlecellmultiomics.statistic.readcount`
	`singlecellmultiomics.statistic.rejectionreasons`
	`singlecellmultiomics.statistic.scchicligation`
	`singlecellmultiomics.statistic.statistic`
	`singlecellmultiomics.statistic.tag`
	`singlecellmultiomics.statistic.trimming`
	`singlecellmultiomics.tags`
	`singlecellmultiomics.tags.tags`
	`singlecellmultiomics.tags.write_tags_md`
	`singlecellmultiomics.tagtools`
	`singlecellmultiomics.tagtools.tagtools`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.4SUtagger`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.bamtagmultiome`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.customreads`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.digest`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.mspjI`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.nlaIII`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.rna`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.scar`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.scchic`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.tag`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.taps`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.tapsTabulator`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.tapsTagger`
	`singlecellmultiomics.universalBamTagger.universalBamTagger`
	`singlecellmultiomics.utils`
	`singlecellmultiomics.utils.binning`
	`singlecellmultiomics.utils.blockzip`
	`singlecellmultiomics.utils.html`
	`singlecellmultiomics.utils.iteration`
	`singlecellmultiomics.utils.sequtils`
	`singlecellmultiomics.utils.submission`
	`singlecellmultiomics.version`